Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX5Q9H2C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms