Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIF3L1Q9GZT8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms