Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SENP6Q9GZR1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP6Q9GZR1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms