Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDGFDQ9GZP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms