Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP44Q9C0F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP44Q9C0F1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms