Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms