Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRNKL1Q9BZJ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRNKL1Q9BZJ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms