Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS3Q9BZE2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms