Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF4Q9BZC1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms