Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms