Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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