Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL1Q9BYD6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL1Q9BYD6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms