Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC8Q9BY41 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms