Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARD11Q9BXL7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARD11Q9BXL7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARD11Q9BXL7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms