Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIOK2Q9BVS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms