Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms