Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKNK1Q9BUB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKNK1Q9BUB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms