Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms