Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT11Q9BT88 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT11Q9BT88 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYT11Q9BT88 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYT11Q9BT88 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT11Q9BT88 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT11Q9BT88 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms