Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UPK3BQ9BT76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms