Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY3Q9BT09 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY3Q9BT09 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms