Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MXRA8Q9BRK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MXRA8Q9BRK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MXRA8Q9BRK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MXRA8Q9BRK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MXRA8Q9BRK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MXRA8Q9BRK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms