Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TXNDC17Q9BRA2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms