Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC77Q9BR77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC77Q9BR77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms