Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUSP9Q99956 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms