Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTRCQ99895 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTRCQ99895 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTRCQ99895 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTRCQ99895 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRCQ99895 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRCQ99895 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTRCQ99895 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRCQ99895 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms