Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYD88Q99836 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MYD88Q99836 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MYD88Q99836 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms