Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSG101Q99816 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSG101Q99816 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSG101Q99816 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms