Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP1Q99575 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP1Q99575 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP1Q99575 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP1Q99575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms