Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGMNQ99538 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGMNQ99538 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms