Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAPLN3Q96S86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAPLN3Q96S86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAPLN3Q96S86 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAPLN3Q96S86 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAPLN3Q96S86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAPLN3Q96S86 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms