Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK15Q96Q40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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