Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC9Q96Q05 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC9Q96Q05 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.8 ms