Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC6Q96NY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms