Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms