Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC114Q96M63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms