Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM227BQ96M60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM227BQ96M60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms