Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00477Q96M19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms