Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHACTR3Q96KR7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PHACTR3Q96KR7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHACTR3Q96KR7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms