Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABS1Q96KC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CABS1Q96KC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms