Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERAC1Q96JX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERAC1Q96JX3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms