Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC45A3Q96JT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms