Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM17Q96I25 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM17Q96I25 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms