Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCED1BQ96HM7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms