Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BCANQ96GW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms