Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC35A4Q96G79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35A4Q96G79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms