Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMP4Q96G21 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms