Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC10A4Q96EP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms