Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms