Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC127Q96BQ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC127Q96BQ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms